Φαίνεται ότι στο θέμα της συμφωνίας του Ελληνικού Δημοσίου με την Microsoft, ο Αλογοσκούφης δεν είχε ενημερώσει την ΕΕ, σε αντίθεση με όσα είπε ο ίδιος, μέσα στην Βουλή. Σχετικό δελτίο τύπου κοινοβουλευτικής ομάδας ΠΑΣΟΚ στο Ευρωπαϊκό Κοινοβούλιο.